锦橙开花座果、果实发育及根系生长高峰,均处于蛋白质急剧分解过程。蛋白质降解愈多,落果愈多,果实膨大愈快,根系发育愈旺。从花蕾期到果实膨大第二次高峰期,蛋白质有三次较大的积累和消耗过程。第一次在花蕾期,积累较高。但在开花和第一次生理落果高峰中,消耗较大,落果最多,占总数的45.17%;第二次积累在果实第一次膨大高峰前,积累低于第一次,消耗也较大;第三次积累在果实第二次膨大高峰前,是蛋白质积累的最高峰,但消耗也最大。这个阶段有16种氨基酸参与,主要的有11种。蛋白质、氨基酸趋势一致,波相交错相反。
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