松杨栅锈菌两菌群RAPD特异序列的标记转换

【目的】根据RAPD分析结果,对松杨栅锈菌西部和北方两大地理相关菌群RAPD扩增特异性DNA片段进行SCAR标记转换。 【方法】经pGEM-T载体克隆和测序、Seqman整合后,用Primerselct分别设计了两地理菌群的简并引物对(西部菌群简并引物对PNW0118-382-F:GAATCGGCCACAAAACTATC,PNW0118-382-R:GAATCGGCCATGACTTGAGC,北方菌群简并引物对PNW0118-400-F:GAATCGGCCACAAAACTATC,PNW0118-400-R:GAATCGGCCATGACTTGAGCTGC)。 【结果】经PCR条件优化成功获得两大地理菌群的SCAR标记。西部菌群SCAR标记为382bp,北方菌群的SCAR标记为400bp。 【结论】两对引物可用于松杨栅锈菌地理菌群的检测。