甜菜幼苗低温和长日照诱导表达基因的克隆和序列分析

以代表性差异分析cDNA-RDA(representationaldifferenceanalysisofcDNA)方法获得在低温和长日照诱导甜菜(BetavulgarisL)幼苗茎尖中差异表达的基因片段DP3,并进行了cDNA的末端快速扩增(rapidamplificationofcDNAends),经RT-PCR扩增和基因组DNA中PCR扩增,克隆测序后获得1个全长609bp的cDNA和855bp的DNA序列,分别命名为Ty7Br600和Ty7Br900,并在GenBank注册,登录号分别为AY324115和AY324114。在GenBank中比较未发现同源序列,可能为新基因。序列分析发现,Ty7Br600具有1个编码136个氨基酸的开放读码框(ORF),Ty7Br900序列中存在1个内含子。分别以克隆的低温诱导甜菜幼苗cDNA为探针,分别进行Northern印记和Southern印记杂交。结果表明,cDNA差异片段只在低温诱导的甜菜中表达,在甜菜基因组中以2个拷贝或低拷贝形式存在。